Mlýn byl dokončen v roce 1836 bratry Karlem a Františkem Budischowskými. Třebíčský větrný mlýn je v Česku jediný, který se používal výlučně na drcení kůry. A to dokonce přes půl století. Síla větru nakonec ustoupila modernímu využití energie a na řadu přišel parní stroj. Objekt měl poté různé využití. Léta v něm nacházela útočiště městská chudina.

Koncem roku 2018 bylo rozhodnuto o opravě větrného mlýna a jeho následném zpřístupnění veřejnosti. Zhotovení projektové dokumentace bylo svěřeno firmě Archatt Památky. Od počátku tvorby dokumentace probíhaly  konzultace s příslušnými odborníky ze Státního památkového ústavu v Telči. Z důvodu nemožnosti obnovy celého původního mlecího zařízení bylo přistoupeno k originálnímu řešení ukotvení větrného kola v půdním prostoru a jeho pohonu elektromotorem.

Ve výběrovém řízení na zhotovení zakázky Obnova větrného mlýna Třebíč - Borovina zvítězila firma  MALANG s.r.o. Brno s cenou 8,3 milionu korun. V průběhu rekonstrukce byly nutné vícepráce. Oproti předpokladu se musely dělat kompletně nové vnější omítky, větší byl i rozsah rekonstrukce vnitřních omítek. Další náklady přinesla technologie brzdného systému na hřídeli, úprava hřídele, doplnění brzdného systému a sloupu u brzdy. Náklady se proti předpokladu zvýšili o zhruba 800 tisíc korun. Město na obnovu památky obdrželo dotaci od Ministerstva pro místní rozvoj ve výši 5 milionů korun.